Dai richiami gotici, è tra le prime chiese francescane d’Italia, costruita subito dopo la canonizzazione del santo (1228). L’aspetto attuale risale all’inizio del XV Secolo. Ha avuto il ruolo di pantheon della famiglia Pico: al suo interno sono custodite le splendide tombe di Galeotto (1499), Prendiparte (1394), Spinetta (1399), e dei genitori di Giovanni Pico (1467). La Chiesa e il convento attiguo hanno ospitato un patrimonio artistico e culturale di incalcolabile valore: opere d’arte, dipinti, statue devozionali, vetrate ricche di rimandi alla storia della città e del tempo. Sono previsti interventi di conservazione, manutenzione, restauro e valorizzazione del bene colpito dal sisma del 2012.